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oligo7官方版是专为DNA研究人员开发的引物设计辅助软件,可以用来设计和分析pcr引物,帮助生物从业人员去更好了解dna,并且进行基因合成,非常适合初学者进行学习。
oligo7电脑版简介
oligo 7是一款着名的引物设计软件,程序具备基于最近邻热力学数据,低聚糖的搜索算法寻找最佳引物PCR,包括TaqMan、高度多路复用,共识或简并引物,支持多个文件的批处理,适合于生物学中的应用。
软件功能
1、正向引物和反向引物选中后,能自动产生PCR实验条件和PCR产物信息
2、分析显示在选中的正向引物或反向引物中基本的成份和溶解温度
3、精确地分析出生物信息软件中的错配位点
4、分析TM和内部稳定性,绘制溶解温度图和稳定性图
5、给出寡核苷酸的重要相关信息
6、显示正向引物、反向引物和当前的OLIGO里潜在的连接物,潜在的二聚物也可显示出来
软件最新方法
1、oligo7的运行环境需要jre 1.4及以上版本方能正常使用,所以用户在安装oligo请先保证电脑中已将安装了java JRE。
2、解压缩包,点击“Oligo7Win_Setup.exe”,根据提示默认安装即可
3、完成原版安装之后,点击桌面的快捷图标启动oligo,在弹出的“OLIGO 7 Customer Registration”对话框中,找到“Workstation Code”信息
4、打开压缩包里的注册机程序“Keygen.exe”,将上面Workstation Code的代码复制到注册机中,点击“Generate”按钮即可生成一组注册码
5、再把注册机中生成的“access Code”复制到“OLIGO 7 Customer Registration”对话框中的“Access Code:”文本框中
6、单击“Confirm Code”按钮即可完成注册最新。
使用教程
1、File菜单下,选择New sequence ,打开窗口将目的序列粘贴进来,或是选择Open定位到目的cDNA序列(在primer中,该序列已经被保存为Seq文件),这是最初打开时的界面:
2、然后就是进行引物的设计了。Search 菜单下,选择for primes &probes ,即出现引物搜寻窗口:
3、根据自己的实际情况选择Parameters 或Ranges设置引物的相关参数和范围。然后选择Search即开始进行引物的搜索,之后会出现软件所列出的依据得分(Score)高低排列设计的引物。
4、双击每一行所列出的引物会弹出该对引物的具体信息,以及软件对该对引物的相关评价。
5、双击之后在最初的Sequence 窗口中就会出现下面的窗口。
6、点击绿色方形图标前面的i标志可了解对应的具体信息。
7、之后便是对该引物的具体分析了,这部分的分析同Oligo 6基本上是一样的。 选择Analyze菜单。
软件评测
软件分为三种图,分别为Frq图、Tm图和ΔG图,能够更好的帮助初学者进行软件的使用和学习。另外该如软件还具备基于最近邻热力学数据,低聚糖的搜索算法寻找最佳引物PCR,包括TaqMan、高度多路复用,共识或简并引物,支持多个文件的批处理,非常适合使用与生物和化学中。
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